Heineken Holding NV, Heineken Grubu'nun yönetim ve denetiminden ve bira ile diğer içecek ürünlerinin üretim ve dağıtımından sorumludur. Şirketin merkezi Amsterdam, Noord-Holland'da olup şu anda 88.497 tam zamanlı çalışanı bulunmaktadır. Heineken Holding NV'nin amacı, Heineken Grubu yönetiminin yönetimini ve denetimini yapmak ve Heineken NV'ye hizmet sunmaktır. Şirket, bağlı şirketleri aracılığıyla temel olarak bira üretiminde ve satışında faaliyet göstermektedir. Heineken Holding NV yapısı, Heineken NV'nin faaliyet bölgelerine benzeyen segmentlere ayrılmıştır: Batı Avrupa, Orta ve Doğu Avrupa, Amerika, Afrika ve Orta Doğu, ve Asya Pasifik. Şirketin hisseleri, L'Arche Green NV, FEMSA ve kamuya açık hissedarlar tarafından elde tutulmaktadır. Dolaylı bağlı şirketleri üzerinden Heineken Holding NV, dünya çapında 70'ten fazla ülkede faaliyet göstermektedir. Şirket ayrıca Pivovarna Lasko dd'yi çoğunluk hissesine sahip olarak işletmektedir.